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人工智能“慧眼识珠”，AI首次独立发现超强抗生素

2020-02-27 09:17:28 来源：科技日报
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人工智能“慧眼识珠”，首次独立发现了一种强大的新型抗生素!

美国麻省理工学院(MIT)科学家在最新一期《细胞》杂志撰文称，他们新研制出的一种深度学习人工智能(AI)，鉴定出一种全新抗生素。

实验室测试表明，这种抗生素能有效杀死多种世界上最麻烦的致病细菌，包括一些对所有已知抗生素耐药的菌株。

在英国《自然》杂志网站2月20日的报道中，研究人员表示，这种名为halicin的抗生素是首个由人工智能发现的抗生素。尽管科学家以前曾使用AI辅助发现抗生素，但此次是AI首次在没有任何人类假设的情况下，从头发现全新抗生素。

美国匹兹堡大学计算生物学家雅各布·杜兰特评论道，这项研究非常出色，研究团队不仅确定了候选抗生素，还在动物实验中验证了有潜力的分子。此外，该方法还可用于发现治疗癌症、神经衰退性等疾病的药物。

无需假设

自发现青霉素以来，抗生素已成为现代医学的基石，但在全球范围内，细菌对抗生素的耐药性正急剧上升。《自然》杂志的报道称，研究人员预测，如果不尽快研发新药，预计到2050年，每年将有一千万人因耐药菌感染而丧生。

但在过去几十年，新诞生的抗生素寥寥无几，且结构上与过去已有抗生素大同小异。此外，当前用于筛选新抗生素的方法成本高昂，且耗费大量时间。最新研究负责人、MIT合成生物学家吉姆·柯林斯说：“人们不断发现相同的分子，我们需要具有新颖作用机理的新型化学物质。我们希望开发一个平台，能借助人工智能的力量，开创抗生素药物发现新时代。”

为寻找新型抗生素，研究团队开发出了一个神经网络模型，这是一种受大脑结构启发的AI算法，可逐个原子学习分子的结构特性。

据MIT网站2月20日报道，在研究中，柯林斯团队使用约2500个分子来训练他们的神经网络模型，以发现能抑制大肠杆菌生长的分子。这些分子包括约1700种已获批的药物(其中300种获批抗生素)以及800种来自植物、动物和微生物的天然物质。

最新研究联合负责人、MIT计算机科学与人工智能实验室电气工程与计算机科学教授雷吉娜·巴兹莱表示，该算法不需要任何药物工作原理方面的假设，也无需对化学基团进行标记，就可以预测分子功能，“因此，该模型可以学到人类专家未知的新模式”。

该模型训练完毕后，研究人员用它筛选一个名为“药物再利用中心”的分子库，该分子库包含约6000种科学家正在研究、用于治疗人类疾病的分子。他们让该模型预测哪种分子能有效抑制大肠杆菌，并仅向他们展示看起来与常规抗生素不同的分子。

从得到的结果中，研究团队选择了约100个分子开展物理测试，其中一种是正研究用于治疗糖尿病的分子。结果表明，它是一种具有很强抗菌活性的抗生素，且化学结构与任何现有抗生素不同。研究人员为致敬经典科幻片《2001太空漫游》，将该分子命名为“halicin”(电影里的人工智能系统名为HAL9000)。此外，研究人员还借助使用其他机器学习模型发现，该分子可能对人体细胞具有较低毒性。

实验室测试表明，除铜绿假单胞菌(一种难以治疗的肺病原体)外，halicin对包括艰难梭菌、结核分枝杆菌和鲍曼不动杆菌等在内的多种病原体具有活性。

为测试halicin在活体动物身上的功效，研究人员用其治疗感染鲍曼不动杆菌的小鼠。鲍曼不动杆菌具有“超级耐药性”，能耐受已知所有抗生素，世界卫生组织已将其定为最需要优先处理新抗生素的病原体之一，人类迫切需要新抗生素来对付它。

研究表明，在感染了鲍曼不动杆菌的小鼠身上，halicin再次显现出神奇效果：含有halicin的软膏在24小时内，就彻底清除了感染。

特立独行

抗生素通过多种机制起作用，如阻断细胞壁生物合成、DNA修复或蛋白质合成中涉及的酶。但halicin并不按常理出牌：它破坏质子在细胞膜上的流动。

MIT的报道指出，初步研究表明，halicin通过破坏细菌在细胞膜上维持电化学梯度的能力来杀死细菌。此化学梯度对于产生ATP(细胞用来存储能量的分子)不可或缺，因此，如果梯度破裂，细胞将凋亡。研究人员说，这种杀伤机制可能会使细菌难以产生抗药性。

柯林斯说：“实验表明，针对抗生素环丙沙星，大肠杆菌会在1到3天内对其表现出抗药性，但即使30天后，大肠杆菌仍未对halicin产生任何抗药性。”

走进新时代

发现halicin后，研究小组利用该模型，对ZINC15数据库内的1亿多种分子展开了筛查。ZINC15是一个在线数据库，包含15亿种化合物的信息。

仅三天时间，该模型就筛查出23种与现有抗生素结构不同且可能对人细胞无毒的候选分子。细菌测试表明，其中8种分子拥有抗菌活性，且2种功能强大。研究人员现在计划进一步测试这些分子，并继续筛查ZINC15数据库。

卡内基梅隆大学计算生物学家鲍勃·墨菲说：“使用计算方法发现和预测潜在药物特性这一领域方兴未艾，最新研究是一个绝佳实例。”

墨菲指出，以前已有科学家开发AI方法来挖掘庞大的基因和代谢物数据库，以识别可能包括新抗生素的分子类型。

但柯林斯团队表示，他们的方法与众不同。新模型不是在搜索特定的结构或分子类别，而是在训练神经网络寻找具有特定活性的分子。

该团队希望与其他团队或公司合作，将halicin用于临床试验，也计划使用他们的模型设计新抗生素并优化现有分子，例如，使特定抗生素仅杀死特定细菌，防止其杀死患者消化道中的有益细菌。

巴兹莱说：“机器学习模型可以在计算机上探索大型化学空间，而传统实验室方法要做到这一点会非常昂贵。”最新研究既提高了化合物鉴定的准确性，又降低了筛选工作的成本。

以色列理工学院生物学和计算机科学教授罗伊·基肖尼表示：“这项开创性研究标志着抗生素发现乃至更普遍的药物发现发生了范式转变，深度学习技术或可应用于抗生素开发的所有阶段——从发现抗生素到通过药物修饰和药物化学改善抗生素的功效和毒性。”

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河南省医药行业协会四届会员大会暨四届一次理事会在郑州召开

11月27日，河南省医药行业协会四届会员大会暨四届一次理事会在郑州召开。河南省卫生健康委员会原主任李广胜，河南省卫生健康委员会基本药物

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如何治疗灰指甲

上海市中医院主任医生苏晓灰指甲(甲癣)是由真菌侵犯手指甲或脚趾甲的甲板引起的的一种疾病，甲真菌病,是皮肤科常见病、多发病。多表现为指(

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丰田“氢擎“驱动全方位电动化低碳出行解决方案倾情助力北京2022年冬奥会和冬残奥会

（2021年11月12日，北京）丰田汽车公司（以下简称丰田）与北京冬奥组委共同举办北京2022年冬奥会和冬残奥会赛事服务车辆交付仪式。丰田汽车

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梦洁21家旗舰店全线引爆，精致生活地标引全城瞩目

在高端床品需求兴起、用户体验感为王的背景下,实体店成为品牌与消费者直接沟通的渠道,门店的规模和形象成为消费者评估品牌调性与发展前景的

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做受信赖的中华美食传播者，紫米食业邀绒言绒语做品牌升级调研

随着消费市场的不断变革，Z世代成为消费主力。蜜雪冰城、江小白、认养一头牛等新锐品牌迅速崛起。品牌IP人格化，成为越来越多企业的共识。

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家庭教育趋势到来，小彼恩积极传递寓教于乐的亲子阅读

2021年10月23日，第十三届全国人大常委会第三十一次会议通过了新制定的《中华人民共和国家庭教育促进法》(以下简称家庭教育促进法)。家庭教

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深耕产品内容，冰雪时光的质高价优之路

无论时代如何变化，市场主流始终是对于高性价比的追求。主打冰淇淋与茶的时尚茶饮品牌冰雪时光所采用的策略也不外如是，即使用高性价比的产

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郑州童瞳眼科医院：让白内障术后孩子视力明显提升

11月24日下午，佳乐(化名)按照预定时间来到郑州童瞳眼科医院做视觉训练，经过近两年的训练佳乐和来到童瞳眼科之前区别很大，不仅仅是视力提

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脚气（足癣）怎么治疗？

上海大华医院主任医生闫萍足癣俗称 "脚气 "，足癣的病变常发生在足趾间、足跟、足跖、足部侧缘等部位，出现水疱、脱屑等表现，并伴有一定痛痒

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如何治疗灰指甲（甲癣）

上海市中医院主任医生苏晓灰指甲(甲癣)是由真菌侵犯手指甲或脚趾甲的甲板引起的的一种疾病，甲真菌病,是皮肤科常见病、多发病。多表现为指(

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三重补贴大聚“惠” 厦门国美再掀低价风暴

双11过了,没赶上低价入手电器和家装的机会?还在等双12?那你就大错特错啦!近日，厦门国美开启11 27惠民消费大补贴活动，家电惠民补贴上限800

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感恩长情陪伴，冰雪时光特惠周边限时发售

品牌如鱼，顾客如水，鱼无水难行，水伴鱼成长。一家对客户怀抱感恩之心的企业，方可在市场中绿树常青。作为一家深耕下沉市场，长期坚持顾客

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童瞳眼科到郑州市实验小学开展视力筛查

为准确掌握学生视力健康状况，采取科学预防措施，有效地保护学生视力。11月22日上午，郑州童瞳眼科医院的工作人员对郑州市实验小学一年级学

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绒言绒语创始人郑淑调研紫米食业，打造速冻美食界的网红爆品

美食界从来不缺少网红，无论是以高颜值用餐环境走红的网红餐厅，还是经网友与美食博主验证的爆款单品，每年都会出现一批市场新宠。传统速冻

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武夷山引领2.0版网红打卡地 激活网红元素 吸引Z世代

武夷山引领2 0版网红打卡地 激活网红元素 吸引Z世代日前，武夷山正式成为国内第一批五大国家公园之一，进一步彰显了其资源禀赋以及保护传

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知名锂电品牌赞充管家充电器：用两年零退货 “不敢想象”

终于见到更安全的充管家充电器啦!我们用两年竟然零退货，不敢想象啊!充管家充电器，质量就是过硬!11月18日，广州琶洲广交会展馆，2021世界

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郑州童瞳眼科医院：行为视知觉+脑知觉训练让孩子视力从0.5提升到1.0

2019年1月28日，一个日常的门诊，童瞳眼科医院姚亮医生接诊了一个特殊的患者小林(化名)。孩子有着一双瓦蓝色漂亮的眼睛，皮肤很白，毛发轻

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让门店“积极发言”，冰雪时光力求品牌宣发“无死角”

夜幕降，华灯上，在忙碌了一整天之后，冰雪时光印象济南三店的店员开始准备打烊，在收拾店内卫生的同时，也没有忘记擦拭门前的啵啵熊模型，

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教学相长、持续进步，冰雪时光商学院为门店赋能

茶饮行业中，开放连锁加盟的品牌占绝大多数。品牌通过加盟拾柴来积聚薪火，在扩大品牌实力的同时，也让门店获利于通过这种合作方式带来的知

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有料有态度，冰雪时光的品牌定位与思考

十年前，新茶饮概念异军突起，全面革新了奶茶的定义，也让茶饮行业从奶精兑水的低档次市场的印象中触底反弹，迎来春天。各大品牌以一线城市

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北京产权交易所荣膺“2021卓越竞争力金融科技影响力企业”

2021年11月9日—15日，由中国经营报社主办，中经未来承办的2021(第十九届)中国企业竞争力年会周汇集8大品牌论坛，线上联动超过200家领军企

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丰田携全方位电动化技术助力北京打造绿色冬奥

再有不到100天时间，举世瞩目的北京2022年冬奥会和冬残奥会就将正式举行。作为全球关注，每四年一次的体育盛会，冬奥会和冬残奥会除了展现

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大唐财富荣膺“2021卓越竞争力品牌建设金融机构”

2021年11月9日—15日，由中国经营报社主办，中经未来承办的2021(第十九届)中国企业竞争力年会周汇集8大品牌论坛，线上联动超过200家领军企

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鲜果好茶做产品，冰雪时光坚守品牌初心

近日，在印象济南·泉世界部分门店，冰雪时光上架了两款名叫王牌车厘子、橙满车厘子的茶饮品。设计十足吸睛的红色台卡，用醒目的金字写着红

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从全方位电动化助力碳中和，看丰田的冬奥答卷

（2021年11月12日，北京）丰田汽车公司（以下简称丰田）与北京冬奥组委共同举办北京2022年冬奥会和冬残奥会赛事服务车辆交付仪式。一直以来

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